发简信
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，...
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2024-11-14 | LDSC——分区遗传力及组织细胞富集LDSC不仅仅可以用于计算以及检验GWAS结果的inflation是否是因为混杂因素（confounding）的影响，还可以有S-LDSC（pa...
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2024-11-10 | LDSC (LD score regression)一、什么是LDSC？ image.png LDSC，LD分数回归，2015年由 Brendan K Bulik-Sullivan 提出的方法，旨...
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2024-11-09 | 孟德尔随机化分析一、孟德尔随机化（Mendelian Randomization， MR）的原理 随机对照实验（RCT）一般被认为是明确因果关系的金标准。其要求...
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2024-10-16 | GWAS数据SNP rsID的注释
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时，因为大多是二代测序的缘故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我们下游有些分...
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2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下，需要你的文件包含CHR BP P三列，无所谓顺序，也无所谓有啥其他列，只要有这三列即可 结果如下
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2024-08-31 | mwget----wget的升级版，超快的下载工具
mwget，m就是multi多线程的意思。mwget是wget的升级版，支持多线程下载，且默认为短点续传。 1、软件安装 当然，我是推荐直接在g...
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2024-05-11 | 记录
道心崩碎，先沉寂一段时间
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2024-04-11 | Jupyter Book & Github Pages--撰写网页书
在我们学习某些东西的时候，经常会用pdf、markdown文件或者ipynb文件等去记录一些分析过程，但是如果文件比较多并且比较长的时候，后面查...