LDSC不仅仅可以用于计算以及检验GWAS结果的inflation是否是因为混杂因素（confounding）的影响，还可以有S-LDSC（partition haritab...
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2024-11-14 | LDSC——分区遗传力及组织细胞富集 -
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2024-11-09 | 孟德尔随机化分析一、孟德尔随机化（Mendelian Randomization， MR）的原理 随机对照实验（RCT）一般被认为是明确因果关系的金标准。其要求研究对象随机分组，为减少偏倚，...
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2024-10-16 | GWAS数据SNP rsID的注释
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时，因为大多是二代测序的缘故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我们下游有些分析却要用到rsid，这时我们会...
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2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下，需要你的文件包含CHR BP P三列，无所谓顺序，也无所谓有啥其他列，只要有这三列即可 结果如下
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2024-08-31 | mwget----wget的升级版，超快的下载工具
mwget，m就是multi多线程的意思。mwget是wget的升级版，支持多线程下载，且默认为短点续传。 1、软件安装 当然，我是推荐直接在github下载编译好的包的，省...
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【Python生信编程笔记】一 、介绍最近想学一下生信编程，但是由于自己是生物专业，对计算机编程也不是太了解，所以感觉还是有很大困难。其实自己对编程还是有一定兴趣，以前也有自学过JAVA，不过现在大家编程好像都用...
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2024-04-11 | Jupyter Book & Github Pages--撰写网页书
在我们学习某些东西的时候，经常会用pdf、markdown文件或者ipynb文件等去记录一些分析过程，但是如果文件比较多并且比较长的时候，后面查阅起来会很麻烦。因此，想着用J...
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2024-04-09 | ggplot各种图展示最近在学习R，在这里介绍下ggplot绘制的各种图形及代码，还是非常好用的 1 数据 用的数据是R中自带的mpg数据集，长这样（部分） manufacturermodeldi...
