论文 A highly conserved core bacterial microbiota with nitrogen-fixation capacity inhabit...
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跟着Nature Communications学作图：R语言ggtern包画三元相图（Ternary plots ） -
文献分享 | Nat Genet：常见 SNP 可以解释人类身高的大部分遗传因素●英文题目：《Common SNPs explain a large proportion of the heritability for human height》 ●期刊...
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组会论文 | Nat Genet：大规模多性状全基因组关联分析鉴定数百个青光眼风险位点《Large-scale multitrait genome-wide association analyses identify hundreds of glaucoma ...
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2024-11-30 | 群体遗传变异——SNP及INDEL calling进行群体遗传学分析的前提是我们得得到变异信息，之前已经介绍了如何进行CNV的识别，那么本文来介绍下如何识别基因组中分布更多、更常见的变异SNP（INDEL顺带） 二代测序 r...
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2024-11-14 | LDSC——分区遗传力及组织细胞富集LDSC不仅仅可以用于计算以及检验GWAS结果的inflation是否是因为混杂因素（confounding）的影响，还可以有S-LDSC（partition haritab...
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2024-11-10 | LDSC (LD score regression)一、什么是LDSC？ image.png LDSC，LD分数回归，2015年由 Brendan K Bulik-Sullivan 提出的方法，旨在从样本量日益增加的GWAS结...
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2024-11-09 | 孟德尔随机化分析一、孟德尔随机化（Mendelian Randomization， MR）的原理 随机对照实验（RCT）一般被认为是明确因果关系的金标准。其要求研究对象随机分组，为减少偏倚，...
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2024-10-16 | GWAS数据SNP rsID的注释
当我们拿到某个研究的GWAS summary data时，因为大多是二代测序的缘故，它的SNP ID可能不是正常的rsid，但是，我们下游有些分析却要用到rsid，这时我们会...
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2024-09-05 | ggplot绘制曼哈顿图----受够了有些包的自定义限制整体脚本如下，需要你的文件包含CHR BP P三列，无所谓顺序，也无所谓有啥其他列，只要有这三列即可 结果如下
