发简信
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利用QTL-seq软件进行BSA定位分析最近逛Github，发现一个新出的BSA自动化流程，就叫QTL-seq[https://github.com/YuSugihara/QTL...
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一套比较简便的基因组组装流程V2.0
之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b188]，时间快2年了，现在新技术...
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利用quickmerge对基因组组装的contig去重
quickmerge是一个用来去除基因组组装中的重复的软件。 该软件没有单独的文章，是作为某个基因组组装中的衍生脚本。该基因组文章是 Impro...
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利用Juicer v2.0挂载染色体
最近在搞基因组，前面contig的组装难度不大，用wtdbg2、raven、mecat2、flye等组装就可以了。 组装完毕后，contig挂载...
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利用masurca进行混合二、三代测序数据基因组组装
现在组装新基因组，一般用pacbio的hifi测序模式进行olc组装+Hi-c辅助组装染色体就行了，但是我们实验室以前测了一些基因组是低覆盖度的...
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一套比较简便的基因组组装流程
这套流程主要特点是消耗资源比较少，1G以内的基因组，内存不要低于128G，最好能搞到256G，但是再多对这套流程用不上，更大的基因组没有测试过。...
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rnaflow 一个新的全自动RNA_Seq数据分析流程最近接了个帮学院其他老师分析水稻转录组的活，但是媳妇赶着毕业，要帮她搞文章和数据，没空干这个，自己虽然会分析转录组，但是一直没有实现自动...
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多线程将SRA文件转化为fastq.gz文件
利用NCBI数据进行分析的时候，遇到的第二个问题就是如何将SRA文件转化为常用的fastq文件。 NCBI官方提供的SRAtoo...
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利用aria2快速下载SRA数据SRA数据就不多说了，目前我遇到的问题是，学校网络不太行，怎么批量快速的下载？ 时代久远，原来我是怎么获得大量的SRA下载地址已...