http://dalexander.github.io/admixture/admixture-manual.pdf[http://dalexander.github.io/...
发简信
IP属地：福建
-
admixture 群体结构分析 -
群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
-
什么年代了，还在用传统的3D-DNA？
之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的辅助组装，它的最大优势就是输出结果可以对接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)进行手动矫正。然...
-
重测序分析（15）GWAS分析实操（1）gwas_emmax介绍如何使用SNP数据进行GWAS分析，软件选择为emmax和tassel。 软件选择 emmaxplinkqqmanCMplot 数据准备 vcf文件：all_snp.vc...
-
基因组结构注释软件列表
基因组结构注释主要包括三个方面：从头注释（de novo prediction）、同源注释（homology-based prediction）以及基于转录组数据注释（tra...
-
用verkko组装基因组
背景介绍 verkko是一个最新的可以应用于二倍体基因组T2T（telomere-to-telomere）级别的基因组组装的组装软件。 2022年9月14号李恒在主题为Pac...
-
基因组survey——K-mer频谱Kmer是从测序数据中滑窗提取出的长度为k的寡聚核苷酸序列，可以评估基因组大小、杂合度、重复序列比例等。在测序reads均匀分布的前提下，有以下公式：基因组长度 = 总碱基数...
-
生信分析|MUMmer4+SyRi
前言 Comparing SVs between two genome：use whole-genome alignment 1、MUMmer4 MUMmer is a sy...
-
两条命令就跑完RNA差异分析数据分析实在太难了，差异分析到底怎么跑啊，怎么才不出错呀！coldata到底怎么构建呀……！别慌，傻瓜包来了！它就是simpleRNA，居然只要两条命令就能跑完复杂的RNA差...
