发简信
IP属地：海南
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互帮互助问答帖
虽然没有几个关注，但能看到这些笔记的应该都是同志们 有时候朋友的私信我可能看不到，我也不一定能解决。 群体遗传学方面、生信方面、R语言等等，如果...
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跟 Susan R. McCouch 学习单基因的进化分析基于 Susan R. McCouch 同期的两篇文献学习一下单基因的进化分析，一篇是发表在 PNAS 上关于水稻香味基因 BADH2 的分析，...
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基于 GetOrganelle 组装叶绿体基因组
GetOrganelle是一款由中国科学院昆明植物研究所的金建军和郁文彬两位老师共同开发的质体组装软件，主要用于从基因组测序数据中组装完整的细胞...
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samtools 一些使用命令
对 SAM 或 BAM 格式的文件进行快速的统计分析： samtools flagstat xx.bam 示例： 415088184 + 0 i...
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LTR finder 和 LTR_retriever 使用说明
LTRfinder是一个用于识别和分析基因组中长末端重复序列（Long Terminal Repeat, LTR）的工具。LTR是一种在许多真核...
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DFOIL 检验
DFOIL 检验是一种用于确定基因流方向的统计方法，它基于五群体系统发育树的分析。DFOIL检验是 ABBA-BABA 检验的扩展，它通过考虑更...
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ABBA-BABA 检验
ABBA-BABA检验是一种用于识别基因流的方法，它基于四群体模型，其中包括两个与第三个群体（P3）密切相关的群体（P1和P2），以及一个外群（...
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awk 从一串字符中提取特定部分
Parent=Os01t0115700-00 从这个字符中提取 Os01t0115700 echo "Parent=Os01t01...
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基于 RepeatModeler 预测基因组的重复序列重复序列在基因组中广泛存在，包括转座子、简单重复序列和低复杂度区域等。这些重复序列对于基因组结构、功能和进化具有重要影响。RepeatModel...