SURVIVOR 软件的功能： 1)Simulate SVs and evaluate existing callers.2) Merge and compare SVs w...
发简信
IP属地：陕西
-
SV 合并软件 SURVIVOR
-
read 读取文件并将变量应用在 awk 中
read 读取文件并将一行中的不同字段存储至不同变量中； 比如说： cat testzhang 10 155wang 8 148 可以用 read name age ...
-
转座子元件注释 RepeatMasker 安装
RepeatMasker是一个用于识别和屏蔽（mask）基因组中重复序列的软件工具。重复序列在基因组中占据了很大的比例，并且对基因组的结构和功能具有重要的影响。RepeatM...
-
结构变异检测软件 SYRI 的使用目前检测结构变异的方法众多，长 reads 序列的比对有 NGMLR、Minimap2、Nucmer 等；基于序列比对结构检测结构变异的软件有 SVIM、Sniffles、S...
-
vcftools 计算 pi、fst、tajima's D
计算每个位点的多态性； vcftools --vcf test.vcf --site-pi --positions SNP_list.txt --out out.txt...
-
bgzip 压缩文件，tabix 建索引
在对 vcf 文件压缩时，不可以用 gzip 来代替 bgzip； 压缩 bgzip -f view.vcf 解压缩 bgzip-d view.vcf.gz 或者gunzi...
-
OrthoFinder 检测同源基因OrthoFinder是一种用于鉴定和比较生物学物种之间的同源基因组学的工具。同源基因是在不同物种之间由共同祖先继承的基因。OrthoFinder旨在帮助研究人员理解基因组学...
-
综述《基于基因组数据检测选择信号》文献题目：DetectingNatural Selection in Genomic Data作者：Vitti etal.发表期刊和年份：Annu. Rev. Genet. ...