MEME 安装 我的一些基本环境 CentOS 7.8 Bash 4.2.46 gcc 9.1.0 并行依赖 / MPICH安装 若需要并行计算的话，在安装MEME之前，需要...
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MEME Motif分析的并行运算
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没有遇到这种情况哦
AlphaFold 3-PyMOL可视化
1. 软件安装 AlphaFold 3分析网站(需要梯子和谷歌账号)：https://golgi.sandbox.google.com/about[https://golgi...
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你好，请问.lk文件是怎么获得的？
计算重组率软件LDhat，CPLDhat，Phase，Mlrho对比
结论 LDhat 详细用法，及切分文件程序，摸我 命令行示例 $LDhat_DIR/interval -seq chrA01_1.site -loc chrA01_1.loc...
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GFF文件转换Genbank文件及Mauve多序列比对前言 有很多软件都可以完成gff文件到genbank文件的转换，如脚本：https://github.com/chundruv/GFF-to-GenBank[https://...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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「生信」共线性分析——MCScanX目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...
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检查自己的数据框
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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按柱子大小排就是根据gene ratio的顺序，在kegg那里写了排序，把根据p值排序换成根据gene ratio排序是一样的。
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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@糖糖婆婆 scale_colour_gradient(low = "blue",high = "red")+ 把代码中的颜色改成你想要的颜色代码就可以
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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文中我的代码是根据p值排序，想要根据count数排序，就在画图前将矩阵按照Count数排列后再画。代码：KEGG_dataset <- arrange(KEGG_dataset,desc(Count))
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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先检查你的输入文件是不是有误，另外代码要根据自己的数据情况进行调整，不是什么都不改就能用的。
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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从david网站点击下载文件，然后会弹出一个结果页面，全选后 复制，在记事本里粘贴并存为txt文件，然后用excel打开整理
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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主成分分析（PCA）& 主坐标分析（PCoA）——R包绘图（2D/3D散点图）导读 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也称主分量分析或主成分回归分析法，是一种无监督的数据降维方法。PCA通过线性变换将原始...
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R包的绘图代码都在里面呀
GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）
导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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GO/KEGG富集分析及R包绘图（气泡图/条形图）导读 利用富集分析，我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如：TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
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16s—β多样性分析（R画三维PCoA图）一、β多样性分析的概念 Beta多样性指的是样本间多样性。在肠道菌群分析中，Beta多样性是衡量个体间微生物组成相似性的一个指标。通过计算样本间距离可以获得β多样性计算矩阵，...
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群体遗传学统计指标——群体间分歧度检验（Fst）基本概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。用于衡量种群分化程度，取值从0到1，为0则认为两...
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