步骤1：数据质控： fastp代码如下，保存为fastp.sh 执行fastp命令，批量处理fastq文件 步骤2：call SNP，使用GAT...

注意，region.xls和 final_sorted_with_promoter.change.gene文件均为bed格式。bed格式前3列为...

将当前目录下大于200Mb，且没有压缩的文件均压缩 这个命令使用find命令来查找当前目录下大于200MB且不以".gz"结尾的文件。然后使用-...

如果你想替换特定的样本名称，你可以创建一个包含旧名称和新名称的文件，然后使用bcftools reheader命令进行替换。这个文件的格式应该是...

安装 R 包agricolae报错：installation of package ‘agricolae’ had non-zero exit ...

SnpSift 可以分割染色体，截取部分vcf文件。具体使用方法见：https://blog.csdn.net/weixin_43569478/...

awk '2<42767716 {print 4"\t"$5}' >R04_R4_1.vcf

import osimport xlwings as xw def excel2pdf(file):app = xw.App(visible=T...