二.变异结果注释与统计 书接上回https://www.jianshu.com/p/ab6a35502786[https://www.jianshu.com/p/ab6a35...
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二代群体遗传与重测序（中） -
Cytoscape绘制相关网络图导读 用R软件corr.test函数进行两组数组的相关性分析，用Cytoscape绘制相关网络图。 一、输入数据 代谢数据：metabo.txt 16S数据：genus.tx...
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annovar注释除人类以外SNP
快速注释已经得到的vcf文件 所需文件 ref.fa gff3文件或者gtf vcf文件 简单流程 1.建立一文件夹 2. gff3文件转变格式 gff3ToGenePred...
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理解OPLS-DA分析的原理和结果图OPLS-DA：正交篇最小二乘法判别分析 原理： OPLS-DA不同于PCA，它是一种有监督的判别分析统计方法。运用偏最小二乘回归建立代谢物表达量与样本类别之间的关系模型，来...
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GATK流程生成多态性的 SNP/InDel
目的：提取群体中多态性较好的SNP和InDel。将GVCF文件进行合并，并提取SNP和InDel，然后使用vcftools获得在群体中多态性较好的SNP和InDel。 第一步...
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R语言ggplot2画气泡图展示富集分析的结果之前的推文介绍了画柱形图展示富集分析的结果，今天的推文介绍一下画气泡图展示富集分析结果的代码。气泡图就是散点图的一个变种。多了一个变量映射给点的大小，富集分析里通常是用来映射...
