IP属地：吉林
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R语言画实现t-SNE分析和画图1.编一个数据 需要一个行为样本，列为变量(例如基因)的矩阵。 2.完成tsne分析并画图 画图搞起 3.神奇参数perplexity perplexity的默认值是30。样...
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网络-networkD3 绘制动态网络可视化数据时，网络可以很好展示各个节点之间的关系以及关系的重要性。网络中存在大量的节点和边，因此绘制一个好的网络会有助于信息的解读。networkD3可以自定义网络的各种特征...
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【基于监督学习的分箱】我的想法被实现了Autometa：从单个宏基因组样品中提取微生物基因组 宏基因组学是一种功能强大的高分辨率技术，可用于原位微生物群落的研究。然而，物种水平的分辨率仅在“分箱”过程之后实现，其...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：raw data sequence及其注意事项笔记内容：拿到原始数据后，在做上游分析之前，需要了解和注意的：16s rRNA是什么，测它有什么用序列文件(raw sequence data)是怎么来的？raw seque...
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收集一些生物信息学的分析流程的文章。感谢这些简友整理的生信分析流程！ 如果简友投稿没有被我收入专题，可能是我没看到或者收入到其他针对性更强的专题中了。望见谅！ 🕛🕐🕑🕒🕓🕔🕕🕖🕗🕘🕙🕚 文章的收录是有顺序的，查看的时候请点击“最新收录”然后进行查看。 👣 全基因组测序(WGS)分析 👣 转录组分析RNA-seq的分析流程 👣 染色质免疫共沉淀技术ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 👣 单细胞scRNA-seq分析 👣 癌症的预后标志物查找 👣 系统发育演化进化树构建与分析 👣 群体遗传学分析 👣 全基因组关联分析(GWAS) 👣 基因家族的分析 👣 甲基化测序与分析 👣 KEGG/GO功能富集分析 👣 图形绘制具体细节的比如热图、曼哈顿图的绘制等 👣 python、perl、R的包的使用过程 👣 具体工具的使用，比如GATK的使用过程 👣 数据库的挖掘方法，比如TCGA数据库的使用 👣 另外就是整个文章走下来的流程 👣 👣 👣
