背景许多短读reads组装的基因组被发现是不完整的并且包含错误。脊椎动物基因组计划一直在生产新的参考基因组组装，重点是尽可能完整和无错误，这需要...
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基因组中的GC 含量和重复元件变化导致基因和染色体的错误丢失
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零基础 | 基因在物种演化尺度的获得与丢失分析写在前面 当我们关注某个基因时，在计划对其开始基因功能研究之前，往往需要先做「基因家族分析」，原因有几： 通过演化树分会初步判断基因可能功能； ...
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Science | ATAC-seq+RNA-seq+泛基因组研究蝴蝶翅膀趋同进化2023年3月10日，来自波多黎各大学Van Belleghem等多团队合作在国际顶级期刊《Science》上在线发表了题为“High leve...
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genblastg和genewise鉴定缺失基因
基于组装好的基因组，例如某一个基因在该基因组中无注释，需检查是否为注释错误，还是该基因本身缺失。 软件：genblastg和genewise g...
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康奈尔大学生物信息中心主任关于基因组组装报告Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任，长期以来从事生物信息学工作，在大数据的管理与分析上，特别是Genotype-By...
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2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fa...
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WGDI - 推断祖先核型0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂具体每个参数的含义参照官方文档, 这里全部用默认参数https://wgdi.readthedoc...
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ChromoSSE: 染色体数目进化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.输入文...
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GFAP注释GFAP注释 go和kegg注释结果 实测比eggnogmaper的结果更全一点
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插件 | 基于序列的 T2T 基因组的着丝粒区域自动判断写在前面 Emmm，基因组组装质量的评估标准有很多，伴随着测序技术的飞速发展，尤其是 pacbio hifi 和 nanopore，现在越来越多...
专题公告
基因组学与比较基因组学
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