最近在做KEGG富集时遇到一个问题:phytozome上的数据采用的注释为Locus tag,但是kobas3.0并不支持这一类型,如此需要进行转换。如果是常见的模式物种还好...

IP属地:湖北
最近在做KEGG富集时遇到一个问题:phytozome上的数据采用的注释为Locus tag,但是kobas3.0并不支持这一类型,如此需要进行转换。如果是常见的模式物种还好...
GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis,中文翻译就是基因集富集分析,最早提出GSEA的文章是下面的这篇文献: 基因集富集分析是...
本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,欢迎点击链接了解更多。 WGC...
WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
1.JTK 使用metacycle包进行JTK的分析,其实metacycle包中可选的分析方法有ARSER(Yang, 2010),JTK_CYCLE( Hughes, 20...
1.目录①转录组学习资源整合 2.目录②生物信息学相关博客、论坛、公众号推荐 3.目录③来自于生信技能树和生信菜鸟团的待刷的生信题目目录 4.目录④生信相关的优质workfl...
基因课FTP地址:ftp://http://gsx.genek.tv/2020-3-10%E7%9B%B4%E6%92%AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%...
比对软件:hisat2 比对率至少70% 饱和性曲线:20M reads数据量即可检测到80%数据量碱基数目:(150+150)X20M(reads数) 表达定量:sub...