深度（depth）与覆盖度（coverage） 假想实验 对长100bp的目标区域进行捕获测序：采用单端测序，每个read长5bp；总共得到了200个reads；把所有的re...
IP属地：江苏
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计算测序深度和覆盖度
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用clusterProfile进行非模式物种且没有参考基因组的GO和KEGG富集分析
新组装的基因组并没有上传和生成RefSeq基因组信息。而且一系列需要or.db或者构建or.db的步骤尝试构建数据库都不成功，要么缺乏物种信息，要么缺乏gene symbol...
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一起学画图：气泡图—常用于富集分析
公众号原文点我[https://mp.weixin.qq.com/s/sVWseQoyxL5tEM5PDf-iuQ] Part 1 ：气泡图 气泡图是散点图的一种变体，一般的...
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单细胞数据分析中的秩和检验与t检验在单细胞数据分析的过程中，寻找差异基因的过程需要用到对基因统计的假设检验（例如函数FindAllMarkers中的test.use参数），我们这里来深入了解一下假设检验的方法...
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R语言ggplot2一幅好看的频率分布直方图实例推文内容来自于链接 https://www.andrewheiss.com/blog/2021/12/18/bayesian-propensity-scores-weight...
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使用fastp进行数据质控
fastp是一款较新的数据质控软件，接触这个软件也是由于目前市场的软件各有功能但是功能都不是很全，譬如最近接触到一个RNAseq数据，质量较差，需要去除接头而且含N较多，序列...
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samtools使用大全
samtools是一个用于操作sam和bam文件（通常是短序列比对工具如bwa,bowtie2,hisat2,tophat2等等产生的，具体格式可以在消息框输入“SAM”查看...
