参考: [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
@热爱大自然的小和尚 感谢感谢!!
生信学习笔记:使用SNP data做基因渗入分析 (4)继续上一周的内容,上次讲到了如何使用--tree Dsuite的功能。要使用--treeDsuite的功能,我们显然需要一个树文件。一般树文件可以通过SNP数据画取进化树来获...
@番茄_9493 你安装LD-deca那里有呀
LD衰减图的理解与应用在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容,也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
工具介绍 Mash扩展了MinHash降维技术,使其成对的突变距离和P值显着性检验,从而可以有效地聚类和搜索大量序列集合。混搭将大序列和序列集还原为较小的代表性草图,进而可以...
由于临近博士毕业,没有再进行更多的生信技能的学习,主要精力都是放在文章发表,毕业论文写作方面。今天的推文继续和大家分享一篇非常好的文章“What makes a plant ...
读文献是每个科研工作者的必修课。无论你是科研小白,你需要通过读文献来入门你所感兴趣的领域。又或者你是学有所成领域内的专家,也要通过读文献来了解领域内的最新发现来修炼内功,扩充...
@不整点没灵感 我不太了解哦这方面。我知道的是如果你数据缺失比较多是需要的
群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义,按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念,我们就需要先理解基因型缺失(genotyp...
@我们一起舔过铁栏杆 10乘的测序深度
群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义,按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念,我们就需要先理解基因型缺失(genotyp...
@13618622625 简书把github的图屏蔽了,我没有重新做床,你可以去github网上去看看
变异vcf文件可视化神器今天给大家带来一款非常方便好用的SNP变异vcf文件可视化神器:VariantQC。听到这个名字有没有似曾相识的感觉,嘿嘿嘿。没错,那就是FastqC了。相信大家对这个软件肯...
是的是的,打错了。我来改一改
谢谢提醒
LD衰减图的理解与应用在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容,也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
是的是的,打错了。我来改一改
LD衰减图的理解与应用在群体遗传学研究中,LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容,也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
熟悉R的朋友都会知道,dplyr包是对原始的数据集进行清洗、整理以及变换的有力武器之一。但是其使用会局限于你需要有打开R/R studio或者通过R脚本来执行dplyr。对于...