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  • @斩毛毛 您好,想请教一下查看MAF时,得到的plink.frq 文件中A1和A2是不是该位点的突变碱基

    plink学习笔记

    官方文档学习更详细,轻用力戳此处[http://www.cog-genomics.org/plink/1.9/input#ped] 1. 基本格式 1.1 ped, map ...

  • 您好,想要请教一下,SNP位点的基因型用Beagle软件填充后,有填充结果的现实吗?(如:多少个缺失,多少个填充成功等)

    用Beagle做基因型填充(Imputation)

    在学习基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing(基因定相、单倍体分型),主要是参考公众号碱基矿工中的一篇文章:人类基因组的Phasing原理是什么。建议多读几遍 Pha...

  • 想要请教楼主,用SNP做亲缘关系鉴定需要做基因型填充吗

    群体遗传学习笔记-基因型缺失数据的填充

    Genotype Imputation是在高通量测序中常出现的定义,按照义译就是基因型填充。要真正理解imputation这个概念,我们就需要先理解基因型缺失(genotyp...