系列回顾:ArchR官网教程学习笔记1:Getting Started with ArchR[https://www.jianshu.com/p/a2bcdfb77961]A...
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背景:单细胞ATAC分析流程介绍。 1.为什么做单细胞ATAC分析? 单细胞转录组分析的是单细胞分辨率上不同细胞之间的转录组(mRNA)差异,由中心法则可以知道,生物发生的过...
作者:Jenny审稿:童蒙编辑:angelica 近几年来,单细胞测序技术一直是讨论热度极其高的话题,除了单细胞转录组,单细胞ATAC也逐渐引起科研人员的兴趣。那么,它与我们...
本文首发于我的个人博客, http://xuzhougeng.top/ 往期回顾: 使用ArchR分析单细胞ATAC-seq数据(第一章) 使用ArchR分析单细胞ATAC-...
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课题需要某一篇已发表文章的基于10x Genomics平台的scATAC-seq数据,于是乎,开始了踩坑指南。 No.1 数据下载 众所周知,公共数据的下载一般主要有GEO和...
ggplot 颜色手动填充 scale_colour_manual(values = myCoulour.plannet ) 从色卡提取颜色 colormap.pngR作图配...
示例数据:GSE178911→GSM5400792→ SRR14915863~SRR14915866 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/que...
写在前面 感谢califano-lab[https://github.com/califano-lab]团队将代码无私的分享出来=。=! 本流程需要一点点R语言与linux基...