发简信
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FeaturePlot画图让有表达的点展示在上方在使用FeaturePlot画图的时候会因为细胞太多存在一些细胞被覆盖的现象，导致表达某基因的细胞由于处于底层而展示不出来。我们如果想要让表达特...
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利用cellranger构建病毒基因组并整合到人中定量分析1.软件和参考基因组文件下载 cellranger下载 建议下载比较新的的，我这个是因为想和原文保持一致所以才下载的老版本官网下载：https:...
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R构建seurat和scanpy 重复基因处理方式不同在处理病毒数据的时候遇到一个问题，由于有不同病毒对应的 蛋白编码基因相同，导致读取的时候出现问题：主要是在R中"ORF1ab"读取为0但是sca...
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destiny包安装 (libstdc++.so.6报错)为了使用DiffusionMap，需要安装destiny，但是遇到报错libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.3...
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Rstudio server卡住无法启动多次遇到rstudio-server服务器自己的用户登录不上，一直卡着，但是别人的用户能正常使用的情况，一般都是自己用户下出现了问题，下面总结几...
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ROGUE： 细胞亚群纯度评估在多篇高分文章中都出现了评估细胞亚群纯度的内容，用到的是张泽民团队的ROGEU包。提出了一个基于熵的统计量(ROGUE)来准确地定量鉴定的细胞团...
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SeuratDisk R包安装 & .h5ad转换为seurat对象h5Seurat 文件格式专门用于存储和分析多模态单细胞和空间分辨表达实验数据，例如来自 CITE-seq 或 10X Visium 技术的数据...
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泛癌内皮 血管生成 炎症 2024 NSR(张泽民)Jinhu Li, Dongfang Wang, Fei Tang, Xinnan Ling, Wenjie Zhang, Zemin Zhan...
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Jupyte安装和远程使用Jupyter是一个开源的交互式计算环境，支持超过40种编程语言，其中包括Python、R、Julia等。它最初是IPython项目的一部分，随...