分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础上，开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
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群体遗传学与重测序分析 -
maker基因组注释一（基础篇）在基因组注释上，MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别重复序列，将EST和蛋白序列比对到基因组，进行从头预测，并在最后整合这三个结果保证结果的可靠性。此外，MAKER还...
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连锁不平衡（LD）分析1.连锁不平衡（LD）概念 连锁不平衡（LD）是指不同位点等位基因的非随机关联。LD 的衰减是受重组率和重组代数影响的，研究 LD 的衰减可以揭示群体重组的历史。 假如位于同...
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基础知识——连锁不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一、概念 连锁不平衡是指,在某一群体中，分属两个或两个以上基因座的等位基因同时出现在一条染色体上的几率，高于随机出现的频率。连锁不平衡是等位基因或者遗传标记在一个种群中表现出...
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共线性分析 | MCscan (Python version JCVI 包)共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。今天主要测试的是Python版McScan（jcvi工具包），这个包很强大，是从MCScanx升级而来的基因组共线性分析软件。 ...
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WSL安装及配置图形界面
镜像下载、域名解析、时间同步请点击 阿里云开源镜像站[https://developer.aliyun.com/mirror/?utm_content=g_100030359...
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【比较基因组】共线性分析（JCVI）比较基因组学中，共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利用MCScanX来做共线性分析，虽然后面有java的包来支持...
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比较基因组学之共线性工具JCVI安装及使用比较基因组学之共线性工具JCVI安装及使用 jcvi及依赖的安装 $ conda create -n jcvi -c bioconda -c conda-forge jcvi...
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海洋哺乳动物的适应性进化文章信息 题目：Comparative genomics provides insights into the aquatic adaptations of mammals ...
