http://www.nxn.se/valent/2017/11/16/droplet-scrna-seq-is-not-zero-inflated 随着scRNA-seq（...
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Droplet scRNA-seq is not zero inflated -
[ 生信者们建议看看 1 ] Ming Tang: 我为生物信息学/数据科学课程选择的书籍/ URL放在最前面的链接：My opinionated selection of books/urls for bioinformatics/data science curricu...
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fgsea做GSEA1.导入测试数据,fgesa的examplePathways，exampleRanks测试数据分别是通路的list和经过fold change排序的基因。 2.运行 fgse...
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跨物种同源基因转换（biomaRt和homologene）2022-06-17
适用背景 当我们进行跨物种比较分析时会发现基因名对不上，或者找不到基因，这时候就需要进行物种间的同源基因转换。最常用的工具就是Ensembl的biomaRt，另外还查到NCB...
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GSEA相关笔记整理网页上关于GSEA富集分析的教程很多，对自己这个生信小白来说比较简单通俗易懂的当数生信宝典和生信技能树的教程了。感谢大佬们的付出。下面是自己整理的个人学习笔记，可能有理解不对...
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GSEA的leading edge analysis(LEA)
前面在GSEA可以做什么[https://www.jianshu.com/p/1cc9f6c20ef6]中列了GSEA的一些应用场景，这个算其中之一，也是相对被遗落的一个分析...
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version `GLIBCXX_3.4.20' not found 解决方法
更新了hisat2的版本后，运行出现了2个错误，error1：/lib64/libstdc++.so.6: version GLIBCXX_3.4.20 not founde...
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用copyKAT推断肿瘤细胞CNV及解决细胞过滤问题本文共分3部分。 首先介绍一下copyKAT原理和使用方法。然后提出一个关于细胞过滤的问题。最后提出一个解决问题的方法供参考。 1.copyKAT及使用简介 copyKAT是...
