作者，Evil Genius 什么是空间轨迹？ 以一个空间位置为起点（例如上图的交界区域），沿着固定方向上的细胞、基因表达的变化。 还有如下的分析结果，沿着相同方向、以相同的...
发简信
IP属地：广东
-
课前准备---空间轨迹 -
三维蛋白结构预测之RoseTTAFold虽然我是生信人员，但是我研究生阶段做的内容跟蛋白结晶有关，蛋白的三维结构非常重要，只可惜当时的我能力有限，仅仅是用swissmodel模拟一下就算了，下面的图是我当年硕士毕业...
-
空间转录组细胞类型的距离分析之二---代码实现其实我平时很少分享代码，因为我觉得代码其实都是抄别人的，没什么意思，理解最重要，但是现实的情况是，大家需要代码作为参考 今天我们来分享的是，对细胞类型在空间距离上的分析，也就...
-
-
空间转录组细胞类型的spot distance-based analyses，距离分析在我们生物学的世界里，细胞类型无论是交流还是位置都是在不断的变化之中，当形成一个成熟的组织之后，细胞类型的位置才会相对固定，但真正意义上也是一种动态平衡，当发生疾病之后，免疫...
-
10X空间转录组做细胞通讯的打开方式10X空间转录组这项技术出现的时间也有了1年多之久，很多分析的思路也已经有了比较深的认识，但是对于细胞通讯而言，无论是发表的文章，还是个人分析，都还是需要很多的探索，今天我们...
-
10X空间转录组的轨迹分析我们做过单细胞的童鞋们来说，轨迹分析并不陌生，然而如果将单细胞的轨迹分析结果运用到空间转录组上，就可以帮助我们了解到细胞随着时间进行的过程中，细胞位置的迁移。其中最常用的方式...
-
RNA速率分析的深入解析RNA速率分析是一个非常重要的分析内容，我们这里来深入解析一下这个分析内容（python版本，个人喜欢python），参考网址在Velocyto[https://velocy...
-
python的魔法函数_init_() 所有类的超类object，有一个默认包含pass的init()实现，这个函数会在对象初始化的时候调用，我们可以选择实现，也可以选择不实现，一般建议是实现的，...