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答读者问(4)：inferCNV的几个问题
1.肿瘤细胞太少怎么办？ Z: 我的样本是肿瘤原发灶、淋巴结转移灶，我的淋巴结细胞恶性细胞基本都是几十个，这样的话是因为我前期过滤太狠了，还是就是淋巴结里面恶性肿瘤细胞很少?...
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[Python/R语言] 用R和python解决数据分析120题 1-20转载请注明：陈熹 chenx6542@foxmail.com （简书号：半为花间酒）若公众号内转载请联系公众号：早起Python题源：公众号 早起python 《Pandas...
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单细胞转录组功能分析（超详细clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异，因此，功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很多，这儿我们主要讲述3种功能分...
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Volcano plot | 别再问我这为什么是火山图
火山图是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p value）和变化幅度相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（基因等）。常应用...
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Seurat数据结构（一）在做单细胞分析的过程中，我们通常要基于Seurat数据之上做多样化的分析：针对某一子集，重新画图等等。所以，我们首先需要对Seurat的数据结构有一个基本的了解。 下面这个图...
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计算特定细胞群对疾病状态的贡献度在单细胞测序揭示心梗后的心脏免疫动态变化[https://www.jianshu.com/p/c5043790077a]中，作者对MI不同时间点的小鼠心脏组织进行了单细胞测序...
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单细胞数据处理小细节汇总1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不加设置，后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
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10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之细胞过滤那些事hello，大家好，今天已经是五一假期的第二天，本人呢，哪也去不了，只好在家歇着，所以呢，给自己找点事做，本人93年，单身，现居天津武清，女孩子有没有想谈恋爱了，可以联系我，...
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收集各种单细胞测序数据分析方法
