在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组...
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ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析) -
m6A-lncRNA week01
title: "m6A-LGG-week1"author: "Hannisal"date: "2020/10/3" 1.TCGA的数据下载 用T...
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单细胞的GSVA通路分析和CellPhoneDB文件的准备单细胞的通路分析 在做单细胞的通路分析的时候，第一就想做GO,KEGG，当然这是对于差异基因，但是单细胞的差异基因往往没有特殊的标准，得不到自己...
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R获取芯片平台与注释【检索】
刘小泽写于18.9.12处理芯片数据离不开注释包，并且不同的芯片数据使用不同的注释。知道GSE号后就能知道GPL平台号，但是怎么把平台和注释信息...
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R语言配色方案: Colors in R前言：巧妙的色彩搭配，能够绘制出更具审美价值的图片，令人耳目一新。本文主要讲解比较受欢迎的R包配色方案。 （一）：RColorBrewer 包 ...
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如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析如何分析芯片数据 我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
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软件的安装
安装java cdmkdir -p biosoft/javacd biosoft/javawget -c -O java.tar.gz http...
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samtools的安装和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和ba...
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ggplot2 008 箱线图及小提琴图1.箱线图 Box plots 1.1 语法 geom_boxplot( mapping = NULL, data = NULL, stat =...
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