复现 - 专题

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复现

收录了45篇文章 · 15人关注

ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)
在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c）组...

6.0 生信start_site 21 90 2
m6A-lncRNA week01
title: "m6A-LGG-week1"author: "Hannisal"date: "2020/10/3" 1.TCGA的数据下载用T...

0.5 Hannisal 4 10

R获取芯片平台与注释【检索】
刘小泽写于18.9.12处理芯片数据离不开注释包，并且不同的芯片数据使用不同的注释。知道GSE号后就能知道GPL平台号，但是怎么把平台和注释信息...

1.1 刘小泽 9 34
R语言配色方案: Colors in R
前言：巧妙的色彩搭配，能够绘制出更具审美价值的图片，令人耳目一新。本文主要讲解比较受欢迎的R包配色方案。（一）：RColorBrewer 包 ...

5.6 谢俊飞 1 38
如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析
如何分析芯片数据我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而...

4.1 xuzhougeng 7 83 1
enrichplot||基因富集结果可视化解决方案
enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...

10.3 周运来就是我 12 89 2
软件的安装
安装java cdmkdir -p biosoft/javacd biosoft/javawget -c -O java.tar.gz http...

0.2 灵动的小猪 0 3

samtools的安装和使用
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一个用于操作sam和ba...

8.2 Nickier 10 128
ggplot2 008 箱线图及小提琴图
1.箱线图 Box plots 1.1 语法 geom_boxplot( mapping = NULL, data = NULL, stat =...

1.6 caoqiansheng 0 20
转录组入门（7）：差异表达分析
这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。...

7.7 xuzhougeng 25 148