第一节 一、背景介绍 大家其实对华大测序的原理什么的都知道，但是以下概念是比较重要的，什么是DNB，bin，我们怎么选择binsize的大小等问题就至关重要了。首先解释以下D...
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STOmics-seq：Stereopy教程 -
NCBI的Remap工具停用随着测序技术的普及和组装技术的完善，物种基因组版本更新很快。如果我们手头的数据是使用老版本基因组分析的结果，可以使用现成的工具直接转换（转换会有一些失败和错误的风险）。之前给...
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测序小知识之名词解释
1、Read depth Read深度：一个样本测序得到的reads数；容易和基因组测序的覆盖度 (多少基因组区域被测到了)和测序深度混淆 (单个核苷酸被测到的次数或所有核苷...
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bwa+bcftools变异检测callsnp
今天根据NC大作1143份籼稻测序数据进行callsnp操作记录 1-下载SRA文件 prefetch --option-file SRR_Acc_List.all.txt ...
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通俗理解：MNN互近邻搜索算法校正scRNA-seq批次效应
MNN来源：Batch effects in single-cell RNA sequencing data are corrected by matching mutual...
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Single Cell 自测
多细胞 1、多细胞是怎样产生的？2、为什么要去除多细胞或若是不去除多细胞对后续分析有何影响？3、去除双/多细胞是在分析的哪一步进行，质控前还是质控后？4、列举去除双/多细胞的...
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搞个linux呗
python中下载scrublet包---doublet检测
Win + R 打开运行窗口，输入cmd回车，打开命令行窗口 找到pip安装路径。image.png Python2/Python3安装路径是相同的，都在C:\Python ...
