一点背景知识 其实生存分析不只有总生存期，TCGA可以很方便的分析的有： OS (Overall Survival) 总生存期: 0 = 患者存...

背景知识 讲课讲到批量的logrank test可以告诉我们两个组之间的生存率差别是否显著，收到提问说： 老师，刚才的 生存分析中，展示了所有基...

0.背景知识 在预后分析中，构建了多因素cox模型后可以选择森林图或者是诺谟图进行可视化。 之前看诺谟图，如果有一个新的病人信息，可以从诺谟图上...

0.背景知识 TIDE评分越高越容易发生免疫逃逸，免疫治疗获益的可能性就越低，评分>0视为无响应，<0视为有反应。 只有网页工具和python版...

刚发了time C-index，收到一条留言 就是机器学习算法应该分训练集与测试集，上次分享的时单个模型，或者多个模型的time C-index...

0.Time C-index C-index 是一致性指数，与AUC值一样是评价模型预测能力的指标，在预后模型里，time-ROC很常见，Tim...

0.转录调控是什么 转录调控网络 （TRN） 由一系列受调控的靶基因和转录因子 （TF） 组成。TF识别特定的DNA序列并影响整个基因组的基因表...

了解到一个发表在bioinformatics的用于多组学聚类的R包MOVICS，学习下他的Vignette。它支持10个聚类算法，综合考虑多组学...

0.需求 想要查询TCGA里的乳腺癌每个样本是什么亚型，并选出LumA和LumB亚型的样本。 这个信息在xena网站上有现成的，如下： 1.读取...