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一 起因 有些开源软件需要编译程序，改变系统环境，从而实现其对应功能。然后，当系统环境改变之后，笔者运行的其他程序可能会受到影响，进而需要重新调整（无用的折腾）。因此，笔者建...

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一 起因 起因很简单，实验室的小伙伴写的新算法需要在论文发表的同时发布到的网上，因此有了以下的过程。 二 调用 第一步，package的发布需要再系统层面完成两步：build...

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一 RoseTTAFold简介 官方介绍：RoseTTAFold能够解决具有挑战性的X射线晶体学和低温电镜建模问题，在缺乏实验确定的结构的情况下提供对蛋白质功能的洞察力，并迅...

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一 alphafold简介 alphafold2应该算是彻底改变计算生物学在生物学家心中地位的利器了。这是一个可以媲美冷冻电镜的人工智能算法，在诸多生物学领域得到了应用。比...

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到今天十一假期就基本结束了，大家过的怎么样呢。接下来的一周可是恐怖的七天上班，大家开不开心呢。 接下来，就由bug开始新的一周吧。 一 问题 在之前的推文《精美网络图绘制《一...

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上一篇推文，笔者有提到一些数据分析方面的经验和教训。当时想以编辑推荐的方式将近期的感悟也一并放上的。但是呢，由于设置的原因，最重要的部分并未介绍，这里一并补上。 首先，随机数...

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一 图一乐之起因 有时呢，睡前刷公众号，发现一篇推文报道一个不会作画的人通过一个人工智能软件实现了在众多人类画家夺冠的伟业（当然，肯定不会像笔者这样简单）。于是，心生一念，要...

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一导言 共线性图作为新近出现的一种数据可视化方式，以其直观、形象的方式受到大家的普遍欢迎，也在众多文章中获得了应用。该图的核心理念就是将不同时期间同一批数据的关系connec...

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算法和数据，作为机器学习或者深度学习中最重要的两把利剑，合力帮助人们解决许多无法靠人力或者简单堆叠去解答的问题。然而，现如今的算法发展突飞猛进，即使是再优秀的人也不可能了解所...

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本篇推文则主要介绍Multi-omics Hammer软件的另一个重磅功能：大文件的矩阵操作套件。使用这一套件可以进行各种文件格式转换，有效减少用户处理文件格式的时间和精力。...

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在之前的推文中我们分别介绍了如何利用这一套件来进行批量索引查找和GO/KEGG注释文件的格式整理，本推文继续上面的内容，介绍本套件的功能：批量元素的数量统计。 一功能开发 对...

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今天的推文主要想介绍了一下如何使用Multi-omicsHammer软件的Genome_relate工具箱的ptree_rename功能，批量修改进化树节点的名称。 一功能开...

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上一篇推文主要介绍了一下Multi-omics Hammer软件的Primer工具箱，本篇就介绍一下如何使用该软件的Genome relate工具箱进行基因长度的统计。更多内...

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在《Multi-omics Hammer软件之‘元素索引的批量查找’》推文中我们着重介绍了如何利用大文件的矩阵操作套件实现“元素索引的批量查找”功能。这篇推文主要介绍一下如何...

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一 功能开发 之前已经在推文介绍了如何使用Aligment功能（《Multi-omics Hammer软件之Aligment功能介绍》）。但是，发现这一功能的使用仍有许多局限...