您好,我这儿出了些问题,麻烦您看看,谢谢您了
>switchListC <- analyzeCPAT(switchList, pathToCPATresultFile="/home/fhh/bud/stem-as/pa.cpat2.ORF_prob.tsv", codingCutoff=0.364,removeNoncodinORFs=TRUE)
>Error in analyzeCPAT(switchList, pathToCPATresultFile = "/home/fhh/bud/stem-as/pa.cpat2.ORF_prob.tsv", :
There seems to be a problem with the CPAT result file. Please check it is the rigth file and try again
IsoformSwitchAnalyzeR 可变剪切分析曾经我用 rMATS 进行可变剪切分析,现在我觉得 IsoformSwitchAnalyzeR 更香。 IsoformSwitchAnalyzeR 功能总结如下。 In su...
请问cpat.result.txt文件是什么样的,为什么我输入了三个cpat结果文件都显示文件错误呢?
RNA-seq学习:No.7IsoformSwitchAnalyzeR包(1)IsoformSwitchAnalyzeR包是2019年才发布的一个分析包,更充分地发挥了RNA-seq数据的价值。学习笔记参考官方文档,示例文件参考R包内嵌数据;回校后再利...