欢迎关注：oddxix 有问题，欢迎后台沟通 概念 广义：转录组（transcriptome）是特定细胞在某一功能状态下转录本的总和。同一细胞在...
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【转录组-1】RNAseq基本知识
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转录组分析实战第五节：EdgeR对表达量矩阵进行基因表达差异分析通过前期的基因定量，我们通过RSEM或者Kallisto这些工具得到了每个基因或者转录本的表达量矩阵。输出的矩阵包含了基因以及在各个样本中的表达...
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RNA-seq中的那些统计学问题（一）为什么是负二项分布？1. 转录组数据统计推断的难题 在RNA-seq中进行两组间的差异分析是最正常不过的了。 我们在其它实验中同样会遇到类似的分析，通常，我们可以用...
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【分享】使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq数据分析易如反掌原文来自这里，略编辑 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力是Bioconductor的核心优势。 RNA-seq分析通常从基因水平的序列计...
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RNA-seq分析：从fastq到差异表达基因
RNA-seq的数据分析是比较简单基础的分析，大概流程就是处理下机的fastq数据（trimmomatic），比对到人类基因组（hisat2）然...
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一套limma、edgeR的实战【上】刘小泽写于18.10.26今晚10.15开始写，先写这么多吧，明天继续 第一部分 背景介绍 选用GEO数据：GSE63310 从雌性小鼠乳腺中提...
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开心回归～复习下之前的学习内容刘小泽写于18.11.12 半年之前我和花花成立了“生信星球”，转眼过得好快，我们每天都能和爱生信的小伙伴们交流，还办了9期培训，灰常开心终于可...
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富集分析
写在前面： 1某些富集代码[https://www.jianshu.com/p/5d82acad6008] |关于GSEA[https:/...
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APAtrap的使用网站：https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 说明书：https://sourceforge.net...
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一个完整的RNA-seq分析pipeline之HISAT2+ StrintTie+ Ballgown以及StringTie和Kallisto的比较(包括得到FPKM、TPM、readscounts)最重要的参考链接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq github链接：https://git...
专题公告
RNA-seq数据分析
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