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OMArk依赖于查询蛋白质组和生命树中预先计算的基因家族之间的快速、无比对的序列比较，可评估整个基因库相对于密切相关物种的完整性和一致性。与BUSCO软件相比，OMArk可以...

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官网：https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF[https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TR...

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最近看到的一些T2T补gap软件软件： softwareDownloadTimeArticleJournalquarTeThttps://github.com/aaranyu...

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@印痕 着丝粒找的是串联重复比较高的地方，然后merge在一起

「基因组」着丝粒和端粒鉴定软件

最近状态不佳，连续两件事情做的时候只想到了一半，做了又等于没做，都成了自己预想的最差的结果，要想做到最佳，只有重做，现在浪费时间结果不合适等于白做。一心多用，今天白搞一下午，...

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1.Quast下载地址:https://github.com/ablab/quast[https://github.com/ablab/quast] QUAST(Qualit...

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「基因组」compleasm评估基因组busco[https://www.jianshu.com/p/8178b1b99a14]「基因组」着丝粒和端粒鉴定软件 [https:...

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@花生学生信 不是大佬，随便混混，哈哈哈哈

基因组评估软件gaep

基因组评估软件geap， GAEP是一款能够基于二代、三代测序以及转录组测序数据，对基因组组装序列的连续性、准确性、完整性和冗余性进行评估的软件。它可以生成包括序列长度、co...

花生学生信

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@花生学生信 我们做的基因组比较多，都是分软件分别跑的，拆分任务并行，速度快，并且分布有check文件，可以续跑。单个基因组可以用用这个慢慢跑

基因组评估软件gaep

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花生学生信

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实测感觉是个单线程软件，数据和基因组太大太慢了，依赖软件也太多，有点鸡肋

基因组评估软件gaep

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花生学生信

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@花生学生信 检索显示有很多：https://www.jianshu.com/p/dc8b5487282b，不过暂时没用过

基因家族分析7 || 顺式作用元件分析

第六部分暂时发现一点问题，改天补充~ 基因家族流程：基因家族分析（一）[https://www.jianshu.com/p/34333a6d7c4e] 基因家族流程：基因家族...

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溪溪溪溪溪川

最近做基因组数据分析多一些，这个是自然，现在可能三五万就可以轻松搞定一个常规基因组（1G以下二倍体），后续可以分析，或者需要分析的内容有很多，可以挖掘的故事也很多。自然而然也...