挖掘公共单细胞数据集时,会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下,方便自己日后调用,以创建Seurat对象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
R语言绘图包系列: R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
谢谢解答😊
单细胞不同组别进行差异基因分析大家做单细胞项目的时候,会涉及到多个组别,在分群之后想进行不同组别的差异基因分析,来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析,在对两组之间的单细胞进行差异分析...
本教程介绍了Kang等人(2017)的[https://www.nature.com/articles/nbt.4042]两组PBMC的对齐方式。在该实验中,将PBMC分为刺...
上一节介绍了两组比较中如何展示差异基因数目,这一节的内容更进了一步,我造了一种图,可以用来表示具体的差异基因。 想象一下你的单细胞数据同时包含对照组和实验组,在做完前期的基础...
你好,请问一下,我的两样本组是veh和D9,我是直接写成ident.1 = "veh",
ident.2 = "D9"吗
单细胞不同组别进行差异基因分析大家做单细胞项目的时候,会涉及到多个组别,在分群之后想进行不同组别的差异基因分析,来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析,在对两组之间的单细胞进行差异分析...
大家做单细胞项目的时候,会涉及到多个组别,在分群之后想进行不同组别的差异基因分析,来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析,在对两组之间的单细胞进行差异分析...
时代的洪流奔涌而至,单细胞技术也从旧时王谢堂前燕,飞入寻常百姓家。雪崩的时候,没有一片雪花是无辜的,你我也从素不相识,到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...