挖掘公共单细胞数据集时，会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下，方便自己日后调用，以创建Seurat对象（1）barcodes.tsv.gz、features.tsv....
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Seurat包之导入单细胞数据方式汇总 -
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
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R语言绘图包03--火山图EnhancedVolcanoR语言绘图包系列： R语言绘图包01--优秀的拼图包patchwork[https://www.jianshu.com/p/e57555d48c91] R语言绘图包02--热...
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Seurat教程：整合刺激性和对照性PBMC数据集以学习细胞类型特异性反应本教程介绍了Kang等人（2017）的[https://www.nature.com/articles/nbt.4042]两组PBMC的对齐方式。在该实验中，将PBMC分为刺...
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04.两组比较_差异基因展示上一节介绍了两组比较中如何展示差异基因数目，这一节的内容更进了一步，我造了一种图，可以用来表示具体的差异基因。 想象一下你的单细胞数据同时包含对照组和实验组，在做完前期的基础...
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单细胞不同组别进行差异基因分析
大家做单细胞项目的时候，会涉及到多个组别，在分群之后想进行不同组别的差异基因分析，来查看不同处理对试验有什么影响。但生信小白只会流程化的分析，在对两组之间的单细胞进行差异分析...
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单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R语言和Seurat已以势如破竹...
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文献学习041--[sc]小鼠20器官单细胞图谱数据库Tabula Muris2018年10月5日，来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心（Chan Zuckerberg Biohub），弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队...
