cytoscape及插件的使用 - 专题

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Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法
Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法：使用老版本。Cytoscape 3.9版本或更低，软件自带安装商店可以正常使用，网上教程...

0.1 潜叶虫 0 1
Cytoscape插件7：MCODE
MCODE,Molecular COmplex Detection发现PPI网络中紧密联系的regeions，这些区域可能代表分子复合体。根据给...

0.5 Y大宽 1 11

功能富集空间分析(spatial analysis of functional enrichment)SAFE
系统功能注释和生物网络可视化 Spatial Analysis of Functional Enrichment(SAFE)，功能富集空间分析 ...

1.4 Y大宽 7 21
Cytoscape插件6：CluoGO+Cluepedia
A: ClueGO:破译富集GO和通路大多数的富集工具都是以列表和复杂等级树显示。Cluoego可视化归纳相似的过程或通路。主要是GO和KEG...

0.7 Y大宽 3 19
Cytoscape插件5：DisGeNET(2)应用实例
1.在CTD里，哪些基因被注释到哮喘病相关广泛的定义为“对于一个给定的基因集来说，哪些基因和某疾病相关？”哮喘病是一个严重的慢性疾病，有时会威...

0.3 Y大宽 1 11
Cytoscape插件5：DisGeNET(1)
基本功能为了产生不同类型的网络，DisGeNET的控制面板提供了可以调整的参数。包含三个标签：gene disease network, di...

0.9 Y大宽 0 6
Cytoscape插件4：iRegulon
对所有生物过程来说，基因表达的精确调控对基因表达是非常重要的。序列特异性的转录因子结合在DNA 识别区域（cis调控元件），并且因此控制目标基因...

0.7 Y大宽 0 14

Cytoscape插件3：Enrichment Map(2)
材料和方法 1.微阵列数据分析所有的微阵列表达数据下载与GEO数据库。Raw.CEL文件用bioconductor的affy包进行RMA。数据...

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Cytoscape插件3：Enrichment Map(1)
富集分析早期的基因列表解释依赖于选择一系列高得分的基因，然后建立相当主观奇怪的关系。富集分析是一个自动的，基于严格的统计学的方法来分析和解释很...

2.0 Y大宽 0 40
Cytoscape插件2：CytoHubba
CytoHubba:发现复杂网络的关键目标和子网络网络对呈现包括PPI，基因调控，细胞路径和信号转导等多种类型生物数据非常有用。我们//+重要性...

1.4 Y大宽 4 21