生信云笔记

日常瞎掰   一图胜千言，说明了其作为一种展现形式在呈现数据结果时的重要性。虽说图的本质是用来展示结果，其最主要的功能是以简单的形式说明数据中蕴含的意义，但有时候好看的外表也...

陈有朴

这篇文章，对Griffith Lab[https://genviz.org/module-04-expression/0004/02/01/DifferentialExpre...

生信start_site

关于ATAC-seq分析，在网上看到两篇关于同一片综述的翻译，写的很好：ATAC-seq数据分析工具的比较和推荐（Genome Biology综述）ATAC-seq生信分析综...

你猜我菜不菜

我是个R新手，只会简单的画一些图，还不能随心所欲的画图。Hadley Wickham男神的ggplot2包以及tidyverse超级大包真是让人膜拜！最近实验室留学生让我帮他...

KS科研分享与服务

最近有小伙伴问道一个问题，如何在一个单细胞UMAP/TSNE图上展示多个marker基因的表达，乍一看挺简单的，后来也是思考了一些时间，慢慢解决了这个问题。 首先，Seura...

尐尐呅

染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序，使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全基因组研究成为可能。 来自同济大学的研究人员开发了人类和小鼠...

秉聿随记

Bismark是做甲基化数据分析常用软件，其中有一个--non_directional的参数，默认是不启用，如果需要时未启用该参数，会导致mapping rate下降近一半。...

生信云笔记

日常掰虾   前面学习了DNA甲基化的基础知识，也了解了它的重要性，不知道的同学看这里，DNA甲基化知识概述[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz...