https://circos.ca/documentation/tutorials/configuration/data_files/
十二. Circos基因组作图前言 最近进行基因组数据分析,绘制圈图,想做两个基因组的比较分析,通过查询文献,发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好,主要就是染色体排布中间对称,这样共线性连线就不会出现交叉...
HapHiC: a fast, reference-independent, allele-aware scaffolding tool based on Hi-C data...
https://www.jianshu.com/p/af25c4c3db37
十二. Circos基因组作图前言 最近进行基因组数据分析,绘制圈图,想做两个基因组的比较分析,通过查询文献,发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好,主要就是染色体排布中间对称,这样共线性连线就不会出现交叉...
一. 准备文件 首先,下载基因组注释文件abc.gff3和蛋白序列文件abc.aa;然后,进行格式转换和重命名,得到abc.gff,abc.lens,abc.pep;接着做b...
前言 最近进行基因组数据分析,绘制圈图,想做两个基因组的比较分析,通过查询文献,发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好,主要就是染色体排布中间对称,这样共线性连线就不会出现交叉...
@没摸周 没装gubbins吧
八. SNP检测和进化分析(Snippy)一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件,可以通过分析得到核心SNP,进行比对构建进化树。 ...
和全部显示的格式一样,只保部分留想要染色体编号
五. 基因组共线性分析-基于MCscanX一. 简介 MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件,发表至今引用数200以上,相关概念和算法参考文献如下: Tang H, Bowers J ...