HapHiC: a fast, reference-independent, allele-aware scaffolding tool based on Hi-C data...
IP属地：贵州
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README:HapHiC
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十二. Circos基因组作图
前言 最近进行基因组数据分析，绘制圈图，想做两个基因组的比较分析，通过查询文献，发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好，主要就是染色体排布中间对称，这样共线性连线就不会出现交叉...
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十三. 基因组核型演化分析-WGDI
一. 准备文件 首先，下载基因组注释文件abc.gff3和蛋白序列文件abc.aa；然后，进行格式转换和重命名，得到abc.gff，abc.lens，abc.pep；接着做b...
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卑微的生信人，如果我的帖子对你有帮助，麻烦点点赞哦
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十二. Circos基因组作图前言 最近进行基因组数据分析，绘制圈图，想做两个基因组的比较分析，通过查询文献，发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好，主要就是染色体排布中间对称，这样共线性连线就不会出现交叉...
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@没摸周 没装gubbins吧
八. SNP检测和进化分析（Snippy）
一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...
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苦逼的科研狗<br>记性不好所以一些东西就写下来加深印象，正好分享给一些需要的朋友
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和全部显示的格式一样，只保部分留想要染色体编号
五. 基因组共线性分析-基于MCscanX
一. 简介 MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件，发表至今引用数200以上，相关概念和算法参考文献如下： Tang H, Bowers J ...
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@神大人_43ad 最后需要重新排序吗？
admixture 群体结构分析
群体遗传学中测的很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看那几个物种聚在一起，一般使用的软件就是STRUCTURE， 但是STREUTURE运行速度极慢...
