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https://circos.ca/documentation/tutorials/configuration/data_files/

十二. Circos基因组作图

前言 最近进行基因组数据分析，绘制圈图，想做两个基因组的比较分析，通过查询文献，发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好，主要就是染色体排布中间对称，这样共线性连线就不会出现交叉...

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HapHiC: a fast, reference-independent, allele-aware scaffolding tool based on Hi-C data...

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https://www.jianshu.com/p/af25c4c3db37

十二. Circos基因组作图

前言 最近进行基因组数据分析，绘制圈图，想做两个基因组的比较分析，通过查询文献，发现棉花基因组圈图在细节方面做的较好，主要就是染色体排布中间对称，这样共线性连线就不会出现交叉...

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一. 准备文件 首先，下载基因组注释文件abc.gff3和蛋白序列文件abc.aa；然后，进行格式转换和重命名，得到abc.gff，abc.lens，abc.pep；接着做b...

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@没摸周 没装gubbins吧

八. SNP检测和进化分析（Snippy）

一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...

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和全部显示的格式一样，只保部分留想要染色体编号

五. 基因组共线性分析-基于MCscanX

一. 简介 MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件，发表至今引用数200以上，相关概念和算法参考文献如下： Tang H, Bowers J ...

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