写在前面 最近主要忙一些植物群体基因组数据的项目。前面提过，赶时间，全基因组的 SNP Calling 使用 GATK 流程，还是需要跑上两三天。但这个还是耗时，并不一定能够...
IP属地：海南
-
教程 | 简单粗暴的叶绿体基因组 SNP Calling 流程 -
十. 基因表达作图--ggplot2::geom_bar一. 简介 利用柱形图展示不同样品中基因表达的整体情况，首先读取基因表达矩阵，再将数据格式转换成row，col，value三列的格式，然后利用ggplot2画图 二. 画图代...
-
「r<-资源」ggplot2优雅绘图指南原文链接：https://pkg.garrickadenbuie.com/gentle-ggplot2/ 截图不易，且看且珍惜。观察每一张图的变化，感受 ggplot2 的...
-
八. SNP检测和进化分析（Snippy）
一. 简介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。 ...
-
教程 | 使用 CPGAVAS2 进行叶绿体基因组注释写在前面 前述，介绍了使用 GetOrganelle 软件进行植物叶绿体基因组组装。测试了下软件，130个样品，直接成环的有76个。手动调整了参数，除了 10 个左右的样品外...
-
【6】蛋白质组学鉴定定量软件之MaxQuant1.简介 2016年，德国马普所的Cox和蛋白质组学领域巨擘Matthias Mann合作开发了MaxQuant软件（MQ），并发表在nbt上，protocol也相应发表在n...
-
WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
-
Markdown基本语法Markdown是一种纯文本格式的标记语言。通过简单的标记语法，它可以使普通文本内容具有一定的格式。 相比WYSIWYG编辑器 优点：1、因为是纯文本，所以只要支持Markd...
