240 发简信
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    CIDP---启动子,基因全长以及CDS序列提取

    因为CIDP需要目的序列,对于没有生信基础的同学来说从基因组提取序列是一个相对痛苦的过程。所以给同学们设置了序列提取模块。请同学们进行软件安装以...

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    CIDP---为sgRNA/guide RNA设计引物

    基本过程是设计完sgRNA后需要将sgRNA插入到载体序列中,这个时候就涉及到了插入哪个位点的问题。因为同学们手中可能有各种各样的载体,所以在这...

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    CIDP---CRISPR sgRNA设计模块

    各位老师、同学,大家好,今天向大家推出一款我最新开发的、用于CRIPSR系统中sgRNA设计的软件,CIDP。 还是老规矩,首先向同学们介绍为什...

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    基因组比对及T2T kmer可视化软件---RAviz功能介绍

    老规矩,先和同学们介绍一下为什么要做这么一款软件?基因组比对paf格式文件: 当同学们需要进行基因组层面的序列比较时,通常要面对如上所示的比对结...

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    GFAP---pfam_go_kegg模块

    后来发现,即便努力实现了各科代表物种的注释,但在某些情况下还是直接注释可能更方便些。于是对GFAP添加了一个新的模块,该模块直接用pfam, G...

  • GFAP---关于版本的汉化

    早年用一些外国软件的时候总是希望能够找到汉化版本,到自己做软件了,反而忽视了这个问题。既然本照着为同学们解决问题的原则,今天终于将GFAP进行了...

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    GFAP---Gene family模块

    嗯,与上一章(GFAP---Transcription factor)的基本操作相同,不浪费同学们宝贵的时间了。区别点在于,该模块所针对是非转录...

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    GFAP---Transcription factor模块

    对于一些没有生信基础的同学来说,想要从一堆未知功能的基因中挑选出想要的转录因子,可能还要花费大量的时间成本去学习这个过程。而转录因子又在植物中起...

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    GFAP---KEGG analysis模块

    该模块主要用于KEGG分析以及作图。首先,需要得到相应基因的KEGG以及KO IDs: 输入文件是先前的比对文件,选择近缘物种,然后保存并命名,...