挖掘公共单细胞数据集时，会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下，方便自己日后调用，以创建Seurat对象（1）barcodes.tsv.gz、features.tsv....
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Seurat包之导入单细胞数据方式汇总 -
Seurat 新版教程：分析空间转录组数据随着转录组技术的发展，空间转录组已经正式走向商业化时代，作为单细胞数据分析的工具箱的Seurat与时俱进，也相应地开发了空间转录组分析的一套函数，让我们跟随卑微小王看看Seu...
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关闭PS和AI的版权提示框在使用Adobe系列软件时，若没有正版授权，则会出现弹窗，该弹窗是由Adobe Genuine Service 软件弹出的，且该弹窗无法关闭，下文介绍如何永久关闭该弹窗。（而...
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R语言可视化（四十）：网络图绘制40. 网络图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用igraph包绘制网络图 使用ggraph包绘制网络图 使用networkD3包绘制动态网络图
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ROGUE：评估细胞亚群纯度说在前面 我们在前面通过3篇推文介绍了张泽民老师的系列研究成果张泽民老师系列文章解读(一)[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY5...
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大数据量单细胞数据处理方式
单细胞数据爆发，现在细胞数据随便就是万和百万级别，除了有许多专门开发出来快速处理百万级的工具包（例如Cumulus等）和down sample的思想外，为了减轻个人PC内存有...
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RNA-seq入门实战（六）：GO、KEGG富集分析与enrichplot超全可视化攻略本节概览：1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG与GO富集4.用enrichp...
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Seurat 报错记录
bug千千万，改完又忘，忘了又出…… 记录在Seurat分析中各种各样的花式bug们🥹🥹 1. FindVariableFeatures()报错 这个是RNA这个assays...
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【基因组学】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化，因此广泛应用于基因组学的研究中。下面我以windows下的IGV为例，介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。 一.下载 下载链...
