写的不错
可汗学院统计学学习笔记（1）1-16集本系列文章为可汗学院统计学的公开课笔记，视频地址：http://open.163.com/special/Khan/khstatistics.html视频讲的很入门浅显，挺好...
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可汗学院统计学学习笔记（1）1-16集本系列文章为可汗学院统计学的公开课笔记，视频地址：http://open.163.com/special/Khan/khstatistics.html视频讲的很入门浅显，挺好...
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load(file = "kegg_info.RData")，1: In readChar(con, 5L, useBytes = TRUE) :
truncating string with embedded nuls
2: file ‘kegg_info.RData’ has magic number 'X'
Use of save versions prior to 2 is deprecated，怎么解决呢？生信 | 构建物种的OrgDb
写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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生信 | 构建物种的OrgDb写在前面 本文主要参考生信小白2018[https://www.jianshu.com/p/bb4281e6604e]与多啦A梦的时光机[https://www.jiansh...
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R读取数据出现“line 1 appears to contain embedded nulls”的解决方法
由于数据可能在Windows下编辑过，保存的是UTF-16的格式用R读取可能会出现以下问题。这种情况有以下三种解决方案。 解决方法一：fileEncoding="UTF16L...
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ubuntu 18.04 安装中文输入法我们的 Linux 漫游之旅已经开始有那么几天了，在前面的文章中，如果你一路跟下来的话，我相信现在你的电脑打开已经和别人的不一样了。你的同学、朋友、同事看到你的电脑都会问你一...
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RNASeq实战练习-hisat2比对与featurecounts定量
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https://www.jianshu.com/p/e9cebbd8ef5...
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Qiime1-17.PICRUSt-16S预测宏基因组？
16S扩增子测序是对细菌中具有代表性的序列进行测序，相比宏基因组测序，16S扩增子测序无法提供基因功能信息，只能给出菌群丰度信息。但是PICRUSt工具可以帮助我们基于16S...
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--p-trim-left 截取左端低质量序列，我们看上图中箱线图，左端质量都很高，无低质量区，设置为0；你说的这句话 ，你图在哪呢
2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
文字转载 DADA2是用于检测和校正（如果有可能的话）Illumina扩增序列数据的工作流程。正如在q2-dada2插件中实现的，这个质量控制过程将过滤掉在测序数据中鉴定的任...
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--p-trim-left 0 \
--p-trunc-len 120 \ 这到底用多少合适呢2021-09-24 qiime2 DADA2 去噪、序列质控和生成特征表
文字转载 DADA2是用于检测和校正（如果有可能的话）Illumina扩增序列数据的工作流程。正如在q2-dada2插件中实现的，这个质量控制过程将过滤掉在测序数据中鉴定的任...
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运行： python /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/figaro/figaro/figaro.py -i /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/data -o /home/yxa/workspace/zhuanluzuyuanshuju/BMK_DATA_20230512141746_1/Data/data -f 1 -r 1 -a 465 -F zymo。出现了：python Forward read files appear to be of different lengths or of varied lengths. {(247, 1.9094949494949496), (247, 1.5660606060606062), (246, 1.9485858585858586), (246, 1.732929292929293), (247, 2.4722222222222223), (247, 2.050909090909091), (247, 2.0277777777777777), (247, 2.0105050505050506), (247, 2.04040404040404), (247, 2.0832323232323233), (246, 1.8273737373737373), (247, 1.538989898989899), (247, 1.6832323232323234), (247, 1.8824242424242423), (247, 1.6262626262626263), (246, 1.4475757575757575), (246, 1.4791919191919192), (247, 1.8460606060606062), (246, 1.9191919191919191)}求大佬帮忙
微生物多样性qiime2分析流程(3) 使用figaro来得到dada2正反向截断参数
dada2插件对原始数据paired-end-demux.qza进行质量过滤需要两个参数，trunc-len-f和trunc-len-r。这个想法是通过尽可能多地删除较低质量...
