你好，我也遇到了这种问题，想问下您具体是怎么操作的呢
单细胞转录组不同数据集合并-基因名不一致问题大家在下载多个数据集的单细胞转录组数据的基因表达矩阵的时候，要注意不同数据集间的矩阵的基因名，有可能同一个基因，名字不一样。例如，CXCL8，又可以叫IL8。如果合并的时候，...
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脑血管内皮细胞亚群细分marker genes
文章来源：A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer's risk[https:/...
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R数据可视化11:相关性图之前我们用热图的形式展现了相关关系，今天我们来用另外几种形式来展现相关关系的图。本文代码来源：Visualize correlation matrix using corre...
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按照这种生信思路，十分钟就可以选到新颖的课题
很多人只知道生信可以批量生产SCI，却不知道利用生信设计课题，有不少国自然课题都是通过生信分析设计出来的。例如前几年比较火的ceRNA，通过生信分析就可以设计出相关的ceRN...
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文献(8): 单细胞和空间分析揭示FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的相互作用
今天分享的这篇文献上个月刚发表在Nature Communications，主要内容是结合单细胞转录组和空间转录组技术，揭示了FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞的互作，及...
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8+非肿瘤生信，bulk结合单细胞结合实验验证，又是非肿瘤干湿结合文章的范文！
影响因子：8.786 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多，主要有以下类型 1 单个疾病WGCNA+PPI分析筛选hub基因。2 单个疾病结合免疫浸润，铁死亡，自噬等基因集，机器...
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空间转录组-肾细胞癌中三级淋巴结构产生浆细胞促进肿瘤抗体产生与传播首篇FFPE空间转录组文章小读: 文献名称:Tertiary lymphoid structures generate and propagate anti-tumor an...
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最新7+非肿瘤生信，机器学习筛选关键基因+样本验证。目前机器学习已经替代WGCNA成为筛选关键基因方法。非肿瘤生信分析欢迎咨询！影响因子：7.31 关于非肿瘤生信，我们也解读过很多 目前非肿瘤中结合热点基因集，免疫浸润，机器学习，分型的分析是比较先进的。有需要的分析的朋友欢迎交流！！ 研究概述： 心房...
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癌症免疫循环中肿瘤的免疫逃逸机制和治疗方法免疫检查点抑制剂的应用（ICIs）彻底改变了各种癌症的治疗模式。然而，尽管在一些癌症患者中取得了成功，但仍有相当一部分患者对免疫检查点抑制剂没有反应。一个正常的癌症免疫循环是...
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答读者问(6)：单细胞TPM矩阵如何分析？问题 一、有的文章只提供TPM的单细胞表达矩阵，可以用seurat分析吗？ 二、分析流程和用count矩阵有什么不同？ 三、10X的单细胞转录组数据的标准化需要考虑基因长度吗...
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跟着Nature学作图:R语言ggplot2簇状柱形图完整示例论文 A global reptile assessment highlights shared conservation needs of tetrapods https:...
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跟着Nature学作图：R语言ggplot2箱线图叠加蜂群图完整示例论文 Graph pangenome captures missing heritability and empowers tomato breeding https://w...
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单细胞聚类及鉴定细胞类型-SingleR目标： 参考：SingleR单细胞类型自动注释与celldex参考数据包[https://www.jianshu.com/p/7a108d518154] 说白了就是根据细胞的...
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