发简信
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immunedeconv踩坑记录
immunedeconv包号称可以利用多种算法进行免疫细胞比例计算，包括quantiseq、timer、cibersort、cibersort_...
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免疫细胞估算R包immunedeconv安装immunedeconv这个R包是一个免疫细胞比例估算集大成者，把常见的免疫细胞估算的算法都包括进去了，包括quantiseq、timer、ci...
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29个免疫特征的基因集（16种免疫细胞和13种免疫功能评分）基因列表TCGA风险模型类生信文章中，经常会对高低风险组进行16种免疫细胞和13种免疫功能评分的比较，就会用到一个29个免疫特征的基因集（16种免疫细胞...
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批量检查和安装R包最近写了个内部用R包，里面有不少依赖包，一部分是CRAN的，一部分是Bioconductor上面的R包，于是把这些包分类后，按照生信技能树培训班...
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花生壳https无法映射Rstudio-server的解决方案之前把服务器放在家里，通过花生壳软件进行内网穿透，采用http协议进行映射。后来由于一些原因，http协议不能使用了，只能使用https。这个时...
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修改ssh中linux命令行配色ssh进行linux远程登录时，用户名、服务器名字都是一片白，也不显示时间，如下图： 生信技能树卖萌哥老师提供了两句代码： 直接在ssh（以xs...
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结合TCGAbiolinks批量下载TCGA临床信息
TCGAbiolinks包常用来TCGA的下载和各种常用分析，本人在使用TCGAbiolinks下载和整理TCGA临床信息时碰到一些麻烦，具体如...
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TCGA泛癌TMB计算在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵（2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jianshu.com/p/9890...
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ESTIMATE R包计算TCGA免疫评分文章参考生信技能树曾老师的帖子：使用ESTIMATE计算肿瘤的免疫得分[https://zhuanlan.zhihu.com/p/1367477...