发简信
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【置顶】BioAider V1.527 新版来袭新版本更加稳定，颜值更高，推荐大家使用。 新版特性概要如下： 一、添加新功能 1. 提供基于核苷酸序列K-mer特征的层次聚类分析工具。 2. ...
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BioAider V1.423新版来袭 + 基因突变棒棒糖图转眼又临近毕业季，离别是总会到来的，但也可以选择留下点什么，如题。 考虑到大家都非常忙，有的甚至还在熬夜写基金，为此我也长话短说。 对于做序列分...
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RaxML使用手册
标签：生信分析，系统发育，进化树 RaxML是最大似然法（ML法）建树的经典软件，可以建有根树，支持服务器上多线程运行。而且RaxML是目前为数...
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RDP使用手册
标签：生信分析，系统发育 背景：RDP是一款检测重组或重配的软件，适用于Windows 95/98/NT/XP/VISTA系统的软件（其实w...
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查找核苷酸或氨基酸序列中的重复基序（重复片段）很多时候，我们需要寻找或者筛选某条序列中存在的重复片段，同时我们事先也不知道有哪些重复片段，以及它们的长度。 相比与其他软件，我更喜欢BioAi...
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如何简单上手序列突变分析？无论是小尺度（少量）的序列集，还是大尺度（大量）的序列集，无论是基因片段的突变分析，还是全基因组的突变分析。 又或者，序列为非编码基因，或非编码...
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序列比对？你可能需要一个图形化界面多重序列比对（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）应该是序列分析中最为基础的操作了，笔者之前发了很大笔墨介绍了M...
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使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩阵在进行序列分析时，难免要做一张序列两两比较的同一性（大致和相似性差不多）表，比如下面这样的： 单一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比较好办，可以通过...
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Jane -- 共进化/跨宿主传播分析
以病毒为例，病毒经常发生跨宿主传播，主要发生在近缘物种之间 。许多人类病毒流行病是由动物跨宿主传播而来，如SARS、MERS、高致病性禽流...