基因组组装 基因组组装一般分为三个层次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示从大规模测序得到的短读(reads)中找到的一致性序列。组...
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纯二代测序从头组装基因组 -
在做DEG差异分析的时候，就需要把ENSMBL id转换成SYMBOL，然后将相同SYMBOL的ENSMBL合并，可以取最大值或者平均值，然后通过SYMBOL进行DEG，后续富集就不需要转换了。
多种方法实现基因ID SYMBOL 与 ENTREZID转换
方法一 ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对clusterProfiler）ID转换用到的是bitr()函数，但我的SYMBOL 转 ENTREZID...
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多种方法实现基因ID SYMBOL 与 ENTREZID转换方法一 ID转换，ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型（针对clusterProfiler）ID转换用到的是bitr()函数，但我的SYMBOL 转 ENTREZID...
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21 Python发送和接收电子邮件邮件是我们日常工作中主要的沟通媒介之一。目前几乎所有编程语言都支持发送和接收电子邮件。接下来将介绍如何使用Python语言发送和接收邮件。 电子邮件介绍 Email（电子邮件...
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FLAGS:0x4 is UNMAP which is segment unmapped
比对文件、samtools 统计、提取比对到的序列、合并
1.比对 magicblast -query myck-gi-1.fq1.gz -query_mate myck-gi-1.fq2.gz -db mussel_mito_ge...
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【宏基因组入门教程】（一）
最近接手了宏基因项目，会在之后接着发一系列的宏基因组入门教程，学习资料大概来自国外的教程。感谢Harriet Alexander, Phil Brooks, C. Titus...
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Kraken使用手册
Introduction Kraken 是可将分类标签分配给DNA序列的一种序列分类器，是基于k-mer精确比对，并采用最低公共祖先(lowest common ancest...
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WGS分析笔记（2）—— bwa vs bowtie2更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前，先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping，一般推荐...
