开始之前特别感谢从美国“人肉背回”这两个软件的小伙伴！@Olivia阿仪_鸦雀 之前讲过目前用的比较多的两个二代测序基因组比对软件，bwa 和 ...

fastp是一个非常方便的基因组数据处理软件，之前在质控的环节就有用到它。 这个软件比较方便的地方就是对于处理前后的数据情况会输出一个可视化的网...

   在找到很多变异以后（本文具体指的是snv以及indel），我们需要做的就是进行注释了，这是因为无论WGS还是WES，都会call出大量的变...

  最近一直忙期末汇报和脚本编写，没来的及接着往下写文章，年前把这一块写了，然后再往下的分析流程就比较特异性了，做一步写一步那种，相对于这种已经...

  上一篇记录了mapping这一步的软件选择，也讲到了对于sam文件如何考虑MAPQ的过滤，这篇我主要想记录一下bam文件在进行call va...