代谢组学(Metabolomics)是研究生物体中小分子代谢物的种类、浓度及其动态变化的学科,能提供生物学过程的最终表型信息。代谢组分析可以结合少样本与群体数据进行多层次研究...
肠道微生物与我们的生命健康息息相关,多种疾病的发生与肠道内菌群的紊乱密切相关,比如:消化系统疾病、内分泌系统疾病、精神系统疾病、自身免疫性疾病以及一些感染性疾病。 为了探究肠...
最近在做一个SCENIC 下游的分析,看到了一个叫CSI(Connection specificity index)的东西,大概的原理就是利用AUC的分数通过pearson相...
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matchAnnot iso-seq注释软件 https://github.com/TomSkelly/MatchAnnot MatchAnnot is a python ...
Iso-seq基础概念,转载自https://blog.csdn.net/weixin_34384681/article/details/85937505[https://b...
Capture Hi-C 是一种检测至少在一端涉及感兴趣的 DNA 区域,如基因启动子染色体相互作用的有效方法。 Chicdiff,是一个用于捕获 Hi-C 数据中差分相互作...
为了节约成本,研究者们通常会把多个样品混在一个文库,并给不同样品加上一段 Barcode 序列。在后续的生物信息分析中,根据 Barcode 序列即可将不同样品的序列拆分开来...
BUSCO是Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs(通用单拷贝同源基因基准)的缩写,基于基因进化(有参比对)评估基因组组装和...
本期内容为[跟着NC做基因组数据分析],这是你需要的教程,对你一定有帮助。 前言今天花费找文章,看到一篇关于基因组,组装的文章,主要是里面的图吸引了我的关注。后面仔细一看,作...
前述,IGV-GSAman 的功能已经更新七七八八,基本可以满足绝大多数情况下的基因结构注释矫正工作需要。不过,我最近带娃比较多,这些时候做不了事情,也只能想一些旁门左道。大...
基因组结构注释主要包括三个方面:从头注释(de novo prediction)、同源注释(homology-based prediction)以及基于转录组数据注释(tra...
请问您知道如何合并多个样本的 cuteSV 的结果吗?
cuteSV鉴定SV一款用于鉴定三代长reads(HiFi, ONT, CLR)的软件。经作者检验,其准确度高于pbsv, svim, sniffles。 安装 简单使用 当然,对于不同类型的l...