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  • 一行代码合并多个空间转录组数据

    写了个简单的程序用于空间转录组数据的和整合，包含的合并方法有以下几种：1.CCA（基于Seurat）2.Harmony3.FastMNN（基于b...

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    EX-ST 膨胀的空间转录组

    最近Nature Method 发表了一篇很有意思的文章，讲述了一个基于Visium改进型的空间转录组，文章借用了Mechanical expa...

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  • 空间转录组---特斯拉 TESLAforST

    这里的特斯拉不是电动车，是一个最近（May 17，2023）发表在Cell Systems 上的一个用于空间转录组数据分析的工具。TESLA (...

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    CellDancer

    细胞不会跳舞我不知道，但似乎nature biotech的文章代码会有毒。。。 CellDancer是最新发表在nature biotechno...

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    科技已经被智子锁死

    nature 于2023 年年初发表了一篇文章，该文章评估了一下过去50年来科研文章的创新性。文章使用了一个叫做CD index 的打分系统：T...

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    智能绷带

    Nature Biotechnology 发了一篇无线智能绷带的文章，很有意思。万物既可以智能化啊。其设计是在电路板上加入了若干感应器，将其贴于...

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    为什么CytoTRACE会失效？

    CytoTRACE是 2020 年发表在Science 上的一个trajectory 推断工具，其原理是基于一个经验性的观察，即基因表达数目和发...

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  • 无知者无畏

    最近在做一个SCENIC 下游的分析，看到了一个叫CSI（Connection specificity index）的东西，大概的原理就是利用A...

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  • CellRank

    ---我不生产代码，我只是个代码的搬运工。 今天来盘盘这个新工具，这个工具的一大优点就是在有或者没有splicing数据的时候，都可以用，效果如...

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