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肝癌单细胞测序数据集查询 -
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提取TCGA中mRNA或lncRNA表达矩阵前面给大家讲解过新版的TCGA数据库中，RNAseq的表达矩阵中加入了一列gene type。 ☞[https://link.zhihu.com/?target=https%...
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R_tips_2: 柱状图排序问题1. 问题描述 使用ggplot绘制柱状图时，我们可能需要对柱进行排序，例如，我们想探究看电视的平均时长和宗教信仰之间的关系： 由于柱子排布没有明显规律，所以图非常难解读。因...
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【实战】circleplot展示GO富集分析结果—附R代码上一期给大家简单介绍了 ☞[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz%3DMzI4...
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从0开始，包括软件安装，环境设置，原始数据下载，转换，差异基因分析等整个流程
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RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 普通安装和配置，请看这篇Linux下bowtie2安装(非conda)和配置 注意 现在清华镜像源...
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11 款可替代 top 命令的工具！作者：JackTian文章首发于公众号：【杰哥的IT之旅】 大家好，我是杰哥。 在 Linux 环境下 top 命令都不陌生，它以实时动态的方式查看系统的整体运行情况，综合了...
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clusterProfiler: 分析+可视化GO和KEGG富集的转录组R包写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
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【R语言】基因ID转换做生物学研究的人，难免会遇到各种各样的基因ID号。有我们比较熟悉的也比较直观的基因名字，如TP53。也有其他数据库里，但是也比较常用的ID，如ensembl ID，entre...
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diamond2: 蛋白序列比对软件本文主要讲述diamond软件的升级版diamond2，该文章于2021年4月7日发表在nature methods上 diamond2主要以blastp为标准。从下图可以看...
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一篇数据挖掘文章的图表复现-10.文章 文章标题：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
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dplyr-mutate-across 选择多列应用函数示例
mutate和across()配合可用于在dplyr数据处理管道(%>%)中方便地选择多列进行相应的函数处理，从而避免了数据处理过程中管道外使用lapply或循环结构，有效保...
