1. GSE138709 5个肿瘤样本 + 3个邻近的正常组织 数据集链接:GEO Accession viewer (nih.gov)[https://www.ncbi.n...
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基础概念 肿瘤突变负荷(TMB) 是指特定基因组区域内体细胞非同义突变的个数,通常用每兆碱基多少个突变表示(mut/Mb),在早期研究中也直接以突变数量表示。 TMB 可以间...
前面给大家讲解过新版的TCGA数据库中,RNAseq的表达矩阵中加入了一列gene type。 ☞[https://link.zhihu.com/?target=https%...
1. 问题描述 使用ggplot绘制柱状图时,我们可能需要对柱进行排序,例如,我们想探究看电视的平均时长和宗教信仰之间的关系: 由于柱子排布没有明显规律,所以图非常难解读。因...
上一期给大家简单介绍了 ☞[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F__biz%3DMzI4...
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 普通安装和配置,请看这篇Linux下bowtie2安装(非conda)和配置 注意 现在清华镜像源...
作者:JackTian文章首发于公众号:【杰哥的IT之旅】 大家好,我是杰哥。 在 Linux 环境下 top 命令都不陌生,它以实时动态的方式查看系统的整体运行情况,综合了...
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, QY He. clusterPr...
做生物学研究的人,难免会遇到各种各样的基因ID号。有我们比较熟悉的也比较直观的基因名字,如TP53。也有其他数据库里,但是也比较常用的ID,如ensembl ID,entre...