随着基因组测序爆炸性增长,比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢?比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之...
基因组和转录组组装质量评估利器——BUSCO(Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs) 一,BUSCO简介 该软件利用Ort...
jcvi软件的使用 官网[https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/300] 软件下载 3 测试数据下载(下载前去Phytozome...
软件下载,安装 软件网页:The Exelixis Lab (h-its.org)[https://cme.h-its.org/exelixis/web/software/r...
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的测序数据;2、SRA数据库下载;这里介绍SRA数据库下载。 ...
今日分析遇到的问题GWAS结果合并很多SNP,想在注释文件中提取某些SNP的注释信息,本来想用R分析,奈何小麦的注释文件最后达到12G,会卡爆我的电脑。就搜索,出来grep ...
前言:因为最近陆陆续续接手了几个物种的基因组项目,这也是生信分析中很大的一块。其中最基础的是组装和注释(当然我们实验室也做组装方法学的研究)。现在随着很多物种基因组的发表,纯...
环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder,然后再安装CAFE 数据准备: 一共会分析mouse, r...
注:这是我参加招行Fintech精英训练营金融工程课程跟着做的笔记,代码是在Pycharm上写的。 里面用到的股票数据均来自雅虎财经(https://finance.yaho...