共线性 共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间,由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基...
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有很多的生信软件都可以通过conda安装,省去了很多的安装、修bug的烦恼。经常是安装到崩溃的软件,conda一行命令就搞定了。前两天有个胖友问...
1.先来认识一下circos的配色体系 下载安装circos之后,在安装目录下面有一个png图片,上面显示的是circos支持的配色和字体样式。...
在「JCVI教程」编码序列或蛋白序列运行共线性分析流程(上)还是有一个尴尬的事情,就是只用到两个物种,不能展示出JCVI画图的方便之处,因此这里...
共线性分析(Synteny analysis)及可视化 基因家族流程:基因家族分析(一)[https://www.jianshu.com/p/3...
1.简介 (1)MCScanX-transposed是基于在相关基因组内和相互之间应用MCScanX,能够检测不同时期内发生的转座基因复制的软件...
一篇不知道拖了多久的笔记……欠下的债早晚还是要还的…… 0.软件下载及安装 官网: http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...
基因组共线性工具MCScanX使用说明 简介 MCScanX工具集对MCScan算法进行了调整,用于检测共线性和同线性区域,还增加了可视化和下游...
MCScanX是检测基因共线性和进化分析的常用工具之一,2012发表至今引用数200+,作者之一的唐海宝老师是国内植物基因组学生信分析、软件开发...
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