Ka/Ks 在遗传学中，Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换（Ka）和同意替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。不导致氨基酸改变...
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2019-07-06
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mcmctree估算物种分歧时间推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...
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基因家族：pfam数据库下载基因家族的HMM模型一、序 目前对蛋白基因家族进行分析主要有两种方法，一基于同源性，二基于HMM模型。想要通过HMM模型预测蛋白基因家族，首先得需要HMM模型数据。HMM模型可以从Pfam数据库...
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生信＋实验：最全单基因研究套路总结
随着测序技术的发展，每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长，越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明，某个基因可能参与了某种肿瘤的...
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基因组学与比较基因组学
