发简信
IP属地：广西
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2019-08-29内容
基因组拼接 基因组Survey：基因组大小、杂合度、重复序列含量评估 拼接策略制定：二代、三代、Hi-C等 拼接原理 拼接软件：SOAPdeno...
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STAMP
STAMP是对两组或多组样本在任何分类水平进行显著性差异分析的软件包，包括物种和功能差异分析。 两组分析时，统计检验（Statistical t...
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K-mer分析常用工具
JELLYFISH KmerGenie GCE
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Teosinte ligule allele narrows plant architecture and enhances high-density maize yieldsTeosinte ligule等位基因缩小植物结构并增强高密度玉米产量 减少空间，但玉米产量更高。为了满足日益增长的食品需求，现代农业的种植日益...
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NG-meta-profiler
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/367755v1.article-infoNG-meta-pro...
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prefetch 使用
sra数据会下载到家目录下的ncbi/public/sra中，perfetch 默认aspera下载（如果存在于环境变量，否则使用https下载...
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Python处理fa文件的1/N种尝试
Part1 ：计算fasta的序列的长度建立一个测试文件 注意点：line.rstrip() 去掉换行吧符，因为不去掉换行符，在文本文件里，换行...
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列表
目的：降低对AKW SED GREP的依赖定义列表是包含有索引的元素集，元素可由字符、数字、字符串及子列表组成，用 list = []表示。 基...
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列表 元组
列表 定义：列表是包含有索引的元素集，元素可由字符、数字、字符串及子列表组成，用 list = []表示。 元组 定义： 元组类似列表，只是元组...